Macross 7 - 35 năm đã trôi qua kể từ khi Lynn Minmay đã mang lại hòa bình giữa người Zentradi và con người trong các sự kiện của Macross. Nekki Basara là một nghệ sĩ guitar và ca sĩ của ban nhạc Fire Bomber. Sống trong một phần kém phát triển của thuộc địa bay City 7 đang tìm kiếm một hành tinh có thể sinh sống, anh sáng tác và hát những bài hát với niềm tin rằng âm nhạc mang sức mạnh lớn lao. Trong chuyến bay, một chủng tộc người ngoài hành tinh không xác định xuất hiện và bắt đầu bao vây City 7. Tuy nhiên, các cuộc tấn công của họ không phải là thông thường - thay vì cố gắng phá hủy, họ đánh cắp thứ được gọi là "spiritia", khiến nạn nhân trở nên vô cảm và giống như zombie. Trong những trận chiến này, Basara luôn đi ra giữa vùng chiến sự, hát những bài hát của mình và mong đợi cả bạn bè lẫn kẻ thù lắng nghe và xúc động bởi âm nhạc của anh. マクロス７ - 西暦2045年。リン・ミンメイの歌により宇宙戦争を終結させてから35年の時が流れた。新マクロス級の7番艦(マクロス7)は移民惑星を求め、7年前地球を旅立ち宇宙旅行を続ける。その船団内では100万人の人々が平和に暮らしていた。しかし、そんなある日、突如としてマクロス艦の前衛艦が奇襲を受ける。一方、マクロス・シティ内の公園に設置された野外ステージでは、ロックバンドのライブが行われていた。そのグループの名は｢ファイアー・ボンバー｣。ボーカル&ギターは破天荒で情熱的な熱気バサラ。ボーカル&ベースはマックスとミリアの7番目の娘、ミレーヌ。キーボード&リーダーに飄々としたレイ。ドラムに寡黙なゼントラン女性、ビヒーダ。ライブが盛り上がりを見せた最中、敵の戦闘部隊がマクロス本艦にまで攻め込んできた。果たしてなぞの船団の目的は、そして正体は…100万の市民の運命を載せ巨大戦艦マクロスは、やがて恐るべき戦いの渦に呑み込まれてゆく……
